目前，農村飲水安全工程建設存在的問題：
水源的水質很難得到保障，我國農村飲用水的水源以地下水為主，但隨著工業(yè)規(guī)模的擴大和社會的不斷進步，地表和淺層地下水的都受到不同程度的污染，另一方面，地下水的過度開采降低了地下水水位，既增加了取水難度，又增加了取水成本。
農村飲水安全工程建設資金投入不足，飲用水處理設備陳舊、水處理設施及輸配水官網不配套，急需政府投資大量精力進行升級改造，提高工程的供水能力。
農村飲水安全工程比較分散，大部分地區(qū)缺乏專業(yè)維護和使用人員，管理難度大。
農村飲水安全工程建設要根據當地實際情況，對現有水資源進行充分利用，向集中化、規(guī)?；l(fā)展，確保工程長期發(fā)揮供水效益。確立每個水廠的管理主體，建立健全管理制度，定期進行現場督查。
農村飲水安全除了合理管理外還要引進先進的管理系統(tǒng)，將自動化的信息系統(tǒng)應用在水資源管理中，以此來簡化傳統(tǒng)工作，實現各水廠的實時監(jiān)控，提高供水管網的規(guī)范化、網絡化。為保障整個農村飲水工程的長效運行，山東鋒士自主研發(fā)了農村飲水安全管理系統(tǒng)，將各水廠的基礎數據管理、運行管理、項目管理、行業(yè)管理等進行電子化，實現水廠的智能、精準控制，系統(tǒng)建成可以提高水廠的安全防護能力，降低生產人員的工作強度，提高水廠的服務能力。在保障水源的同時又可以監(jiān)控整個輸水管網的水質安全。
加強節(jié)水意識宣傳，將安全用水、環(huán)境衛(wèi)生及健康教育對群眾進行宣傳，提高群眾對飲用水安全的認識，讓群眾充分認識到水是生命之源，保護水源地的必要性。
